устанавливает верхний (если положительный) отступ позиции tooltip
gantt.config.tooltip_offset_y = 40;
gantt.init("gantt_here");
Эта опция определена в расширении tooltip, поэтому вам необходимо активировать плагин tooltip. Подробности читайте в статье Тултипы для элементов Gantt.